ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร เช่น ยากำจัดศัตรูพืชและสารกำจัดเชื้อรา เนื่องจากมีโครงสร้างที่สามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการออกฤทธิ์ นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาใหม่ๆ โดยเฉพาะยาที่มีฤทธิ์ต้านการอักเสบหรือต้านเชื้อแบคทีเรีย ในกระบวนการวิจัยและพัฒนา 3-Chloro-1-methyl-1H-pyrazole ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและการสร้างสารประกอบใหม่ที่มีศักยภาพในการใช้งานหลากหลาย