ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการรักษามะเร็ง ฟังก์ชันอัลไคน์ของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาคัปปลิ้งที่มีประสิทธิภาพ เช่น click chemistry ซึ่งช่วยในการประกอบโมเลกุลที่ซับซ้อนอย่างรวดเร็วในการค้นพบยา นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยด้านเกษตรเคมีเพื่อออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีความเลือกสรรและประสิทธิภาพที่ดีขึ้น คุณสมบัติโครงสร้างของมันช่วยเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับกับระบบชีวภาพที่กำหนดเป้าหมาย ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษา