ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางที่ได้รับการป้องกันสำหรับอนุพันธ์ไพราซอล โดยเฉพาะในการพัฒนาเภสัชภัณฑ์และเกษตรเคมี กลุ่ม trimethylsilyl ethoxymethyl (SEM) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับอะตอมไนโตรเจน ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกที่ได้ที่ตำแหน่งอื่นของโมเลกุล นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมสารประกอบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน โดยที่กลุ่มไนโตรสามารถถูกย่อหรือปรับแต่งเพิ่มเติม สารนี้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างยาที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ