2,3-Dicyanopyrazine ใช้หลักในการสังเคราะห์ยาและสารประกอบอินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกหลากหลายชนิด โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาวัสดุสำหรับการประยุกต์ทางอิเล็กทรอนิกส์ เช่น เซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์และไดโอดเรืองแสง (LEDs) นอกจากนี้ ยังมีประโยชน์ในการสร้างสีย้อมและเม็ดสี เนื่องจากความสามารถในการก่อตัวคอมเพล็กซ์สีที่เสถียร ในงานวิจัยด้านเคมีเกษตร ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชชนิดใหม่ โดยอาศัยปฏิกิริยาของมันเพื่อสร้างสารป้องกันพืชที่มีประสิทธิภาพ