สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมขั้นสูง โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) สำหรับยารักษา โครงสร้างของมันซึ่งมีวงแหวนไพราซีนพร้อมตัวแทนคลอโรและไตรฟลูออโรเอทอกซี่ ทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าในเคมียารักษา มักใช้ในการสร้างโมเลกุลที่กำหนดเป้าหมายเส้นทางชีวภาพเฉพาะ เช่น การยับยั้งเอนไซม์หรือการปรับเปลี่ยนตัวรับเซอร์ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการวิจัยเกษตรเคมี ซึ่งช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชใหม่ เนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์ กลุ่มไตรฟลูออโรเอทอกซี่ช่วยเพิ่มความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพของสารประกอบ ทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบในการค้นพบยาและการศึกษาป้องกันพืชผล