2-Chloro-6-(piperazin-1-yl)pyrazine เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม มักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือ intermediate ในการผลิตยาชนิดต่าง ๆ เช่น ยาต้านเชื้อแบคทีเรียหรือยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาท เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งส่วนไพเพอราซีนและไพราซีน ซึ่งช่วยให้เกิดการปรับเปลี่ยนทางเคมีได้หลากหลาย เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะของยา นอกจากนี้ยังอาจถูกนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ เพื่อศึกษาคุณสมบัติทางชีวภาพและฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา