สารนี้ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่มีโครงสร้างเป็นสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งมีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพ หรือยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง ด้วยโครงสร้างที่มีหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) เป็นหมู่ป้องกัน (protecting group) ทำให้สามารถควบคุมการเกิดปฏิกิริยาได้อย่างเลือกสรรในขั้นตอนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน โดยสามารถถอดหมู่ Boc ออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างสารตั้งต้นที่ใช้ในขั้นตอนต่อไปของการพัฒนายา นอกจากนี้ โครงสร้างของสารอนุพันธ์อิมิดาโซพิราซีนยังมีศักยภาพในการจับกับตัวรับเฉพาะในร่างกาย จึงเป็นโครงสร้างหลักที่น่าสนใจในงานวิจัยด้านเคมีทางการแพทย์