6-Chloro-3-hydroxypyrazine-2-carboxamide ถูกนำมาใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยาต่าง ๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โดยเฉพาะยาปฏิชีวนะและยาต้านเชื้อราเพื่อต่อสู้กับการติดเชื้อจากแบคทีเรียและเชื้อรา มีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาเนื่องจากโครงสร้างที่ยับยั้งการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ และสามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเสถียรของยา นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเพื่อพัฒนายาใหม่ ๆ มีการศึกษาต่อเนื่องเพื่อประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเป็นสารป้องกันโรคพืช ช่วยลดการแพร่กระจายของเชื้อโรคในพืชผลทางการเกษตร และยังใช้ในเคมีอินทรีย์เป็นสารตั้งต้นสำหรับสารประกอบที่ซับซ้อนมากขึ้น