ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร หน้าที่ของไอโอดีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาข้ามคู่ เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Heck ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน แหวน tetrahydropyran ทำหน้าที่เป็นวงแหวนเฮเทโรไซคลิกที่มีออกซิเจนที่เสถียร มักใช้เป็นกลุ่มปกป้องหรือเลียนแบบโครงสร้างในออกแบบยา นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์ผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติที่ซับซ้อนซึ่งต้องการวงแหวนออกซิเจนหกสมาชิกพร้อมตัวจับฮาโลเจนสำหรับการทำงานเพิ่มเติม