2,4-Pteridinediol ใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางชีวเคมี โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์อนุพันธ์เพทริ딘ต่างๆ อนุพันธ์เหล่านี้มีความสำคัญในการศึกษากลไกของเอนไซม์ โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญโฟเลต สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาบำบัดที่มีศักยภาพ โดยมุ่งเป้าไปที่โรคที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางโฟเลต เช่น มะเร็งบางชนิดและโรคภูมิต้านตนเอง นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการเตรียมสีย้อมเรืองแสงและตัวบ่งชี้สำหรับการถ่ายภาพเซลล์และการทดสอบวินิจฉัย บทบาทของสารนี้ในด้านเหล่านี้เน้นย้ำถึงความสำคัญในการส่งเสริมการวิจัยทางการแพทย์และเทคโนโลยีการวินิจฉัย