เอทิลามีน ไตรฟลูออโรอะซิเตต ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารเคมีหรือสารกลาง มันมีบทบาทในการเตรียมสารประกอบต่างๆ โดยเฉพาะในงานวิจัยเภสัชกรรม ซึ่งช่วยในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) คุณสมบัติของมันทำให้เหมาะสำหรับใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ ซึ่งช่วยในการป้องกันและถอนการป้องกันของหมู่แอมิโนระหว่างการก่อตัวของพันธะเปปไทด์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในเคมีวิเคราะห์ในฐานะสารอนุพันธ์เพื่อเพิ่มการตรวจจับและการแยกสารประกอบในเทคนิคเช่นโครมาโทกราฟีก๊าซหรือสเปกโทรเมตรีมวล ความเสถียรและปฏิกิริยาของมันยังทำให้มีคุณค่าในการผลิตสารเคมีพิเศษและสารเคมีละเอียดสำหรับการใช้งานอุตสาหกรรม