Allyl β-D-Galactopyranoside ใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีและพัฒนายาเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์คาร์โบไฮเดรตซับซ้อนและไกลโคคอนจูเกต ซึ่งจำเป็นสำหรับการศึกษาการส่งสัญญาณระหว่างเซลล์และการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งไกลโคซิดาเส ซึ่งมีศักยภาพในการรักษาโรค เช่น เบาหวานและการติดเชื้อไวรัส นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนาวัคซีนที่ขึ้นอยู่กับคาร์โบไฮเดรต โดยช่วยในการสร้างโครงสร้างแอนติเจนเฉพาะเจาะจง กลุ่มอัลลิลของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติมได้ ทำให้เป็นเครื่องมือที่หลากหลายในการสังเคราะห์สารอินทรีย์และการค้นพบยา