สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในวิธีการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) มันทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยสำหรับสร้างเปปไทด์ที่มีคุณสมบัติโครงสร้างเฉพาะ โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับไดเปปไทด์ pseudoproline กลุ่ม Fmoc ปกป้องส่วนปลายอะมิโนระหว่างการสังเคราะห์ ในขณะที่กลุ่ม Boc ปกป้องสายข้างของไลซีน เพื่อให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรร โครงสร้าง pseudoproline (Ser[Psi(Me,Me)Pro]) มีประโยชน์อย่างยิ่งในการปรับปรุงความละลายของเปปไทด์และลดการรวมตัวระหว่างการสังเคราะห์ ซึ่งสำคัญสำหรับการสร้างลำดับเปปไทด์ที่ซับซ้อนหรือยาว สารนี้มีคุณค่าต่อการพัฒนาเปปไทด์บำบัด เปปไทด์วิจัย และ peptidomimetics ที่ต้องการการควบคุมการพับและความเสถียรของเปปไทด์อย่างแม่นยำ การประยุกต์ใช้ยังเกี่ยวข้องกับการค้นพบยาและการวิจัยทางชีวเคมี เพื่อศึกษาการโต้ตอบระหว่างโปรตีนและกลไกเอนไซม์