ใช้ Boc-D-Prolinol เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างเปปไทด์ โดยเฉพาะในงานผลิตยาที่ต้องการความจำเพาะของไอโซเมอร์ เนื่องจากเป็นอนุพันธ์ของโปรลีนที่มีหมู่ป้องกัน Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำให้ควบคุมการเกิดปฏิกิริยาได้อย่างแม่นยำ เหมาะสำหรับใช้ในขั้นตอนการสร้างโครงสร้างไซคลิกหรือสารที่มีโครงสร้างสามมิติเฉพาะตัว เช่น สารยับยั้งเอนไซม์หรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังนิยมใช้ในสังเคราะห์สารตั้งต้นของยาในกลุ่ม antiviral และ anticancer ที่ต้องการโครงสร้าง D-อะมิโนแอซิดเพื่อเพิ่มความเสถียรต่อการสลายตัวในร่างกาย