Fmoc-D-Lys(Aloc)-OH ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) เนื่องจากกลุ่ม Fmoc ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันที่สามารถถอดออกได้ง่ายด้วยเบส ในขณะที่กลุ่ม Aloc ปกป้องสายข้างของไลซีน ซึ่งสามารถถอดออกได้โดยใช้สารเคมีเฉพาะ เช่น แพลเลเดียม ตัวนี้ช่วยให้สามารถควบคุมการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มีไลซีนในตำแหน่งเฉพาะได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาและการศึกษาทางชีวเคมี เพื่อสร้างโมเลกุลเปปไทด์ที่มีความซับซ้อนและมีประสิทธิภาพทางชีวภาพสูง