Fmoc-D-Lys(Dde)-OH เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์แบบโซลิดเฟส (Solid-phase peptide synthesis) เนื่องจากมีกลุ่มป้องกัน Dde (1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxocyclohexylidene)ethyl) ที่สามารถกำจัดออกได้อย่างเฉพาะเจาะจงด้วยสารไฮดราซีน (hydrazine) โดยไม่กระทบกับกลุ่มป้องกันอื่นๆ เช่น Fmoc (9-fluorenylmethoxycarbonyl) ซึ่งช่วยให้สามารถควบคุมขั้นตอนการสังเคราะห์ได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างเปปไทด์ที่มีกิ่งข้าง (side chain) ที่ซับซ้อน หรือในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนและเปปไทด์ในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา