Z-D-Pyr-OH ถูกใช้หลักๆ ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นกลุ่มปกป้องสำหรับหมู่คาร์บอกซิลของกรดอะมิโน มันช่วยป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ระหว่างการก่อตัวของพันธะเปปไทด์ ทำให้การสังเคราะห์ดำเนินไปอย่างราบรื่นและเลือกสรร สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน ซึ่งการควบคุมลำดับปฏิกิริยาอย่างแม่นยำเป็นสิ่งสำคัญ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการพัฒนายา ทำให้สามารถสร้างยาที่มีฐานเป็นเปปไทด์ที่มีความจำเพาะและประสิทธิภาพสูง ความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ ทำให้เป็นตัวเลือกที่เชื่อถือได้สำหรับนักวิจัยและนักเคมีที่ทำงานในเคมีอินทรีย์และเคมียา