Fmoc-Dap(Alloc)-OH ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) สารนี้ทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยที่กลุ่ม Fmoc ปกป้องความเป็นอะมีนในระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์ กลุ่ม Alloc ให้การป้องกันเพิ่มเติมสำหรับกลุ่มข้างของกรดไดอะมิโนโพรพิโอนิก (Dap) ซึ่งช่วยให้สามารถกำจัดกลุ่มป้องกันได้อย่างเลือกเฉพาะและปรับแต่งเพิ่มเติมเมื่อจำเป็น สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อนและเปปไทด์เลียนแบบ (peptidomimetics) ซึ่งต้องการการควบคุมปฏิกิริยาของกลุ่มข้างอย่างแม่นยำ การนำไปใช้มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาเปปไทด์เพื่อการบำบัด โมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ และเครื่องมือวิจัยในชีวเคมีและเคมียา