สารเคมีนี้ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์และเปปไทโดมิมิติกส์ เนื่องจากบทบาทของมันในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน กลุ่มเทอร์ต-บูทอกซี่คาร์บอนิล (Boc) ทำหน้าที่เป็นส่วนป้องกันสำหรับกลุ่มฟังก์ชันอะมีน ซึ่งช่วยให้สามารถเกิดปฏิกิริยาเลือกที่ได้เฉพาะที่ตำแหน่งอื่น ๆ ของโมเลกุลในระหว่างกระบวนการคัปพลิงเปปไทด์ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) ซึ่งช่วยในการสร้างโซ่เปปไทด์แบบทีละขั้นตอน นอกจากนี้ สเตอริโอเคมีของมันยังทำให้มีประโยชน์ในการพัฒนาโมเลกุลคีรัล ซึ่งจำเป็นต่อการวิจัยเภสัชกรรมในการสร้างยาที่บริสุทธิ์แบบเอนานติโอเมอร์ กลุ่มเบนซิลยังเพิ่มความยืดหยุ่นให้กับสารนี้โดยให้จุดยึดสำหรับการปรับแต่งเพิ่มเติมหรือกลยุทธ์การถอดป้องกัน