สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางที่ได้รับการป้องกันสำหรับการเตรียมเปปไทด์และสารประกอบชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีกลุ่ม tert-butyl carbamate ช่วยให้ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับอะมีน เพื่อให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกสรรได้ในกระบวนการสังเคราะห์ที่ซับซ้อน กลุ่ม methoxy(methyl)amino ช่วยเพิ่มความเสถียรและปฏิกิริยา ทำให้เหมาะสำหรับการสังเคราะห์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายา มักใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ ซึ่งการควบคุมกลุ่มฟังก์ชันอย่างแม่นยำเป็นสิ่งสำคัญ นอกจากนี้ กลุ่มเบนซิลยังให้ความยืดหยุ่นเพิ่มเติมในการแปลงเคมี ทำให้สามารถใช้ในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่หลากหลาย