N-(Trifluoroacetyl)Glycine ถูกใช้หลักๆ ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในการผลิตยาและสารเคมีเกษตร มันทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการเตรียมสารประกอบที่มีกลุ่ม trifluoromethyl ซึ่งมักถูกนำเข้าไปเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและ bioavailability นอกจากนี้ ยังใช้ในเคมีเปปไทด์สำหรับการดัดแปลงกรดอะมิโน ทำให้สามารถสร้างเปปไทด์เฉพาะทางที่มีคุณสมบัติพิเศษ กลุ่ม trifluoroacetyl ของมันทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันในระหว่างปฏิกิริยาเคมี เพื่อให้มั่นใจในการแปลงแบบเลือกสรรในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน