สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ในฐานะบล็อกก่อสร้าง กลุ่ม Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับส่วนอะมิโน ช่วยให้สามารถประกอบโซ่เปปไทด์ได้อย่างควบคุมและทีละขั้นตอน โครงสร้าง cyclohexyl ให้ความแข็งแรง ซึ่งสามารถส่งผลต่อคุณสมบัติการพับตัวของเปปไทด์ที่ได้ อาจเพิ่มความเสถียรหรือกิจกรรมทางชีวภาพ มักใช้ในการพัฒนายาเปปไทด์ วัสดุชีวภาพ และเครื่องมือวิจัยสำหรับศึกษาการโต้ตอบของโปรตีน นอกจากนี้ ยังใช้ในเคมีคอมบิเนตอริอัลเพื่อสร้างไลบรารีเปปไทด์ที่หลากหลายสำหรับการคัดกรอง