Boc-β-HoPhe-OH ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับส่วนของอะมีน เพื่อป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการระหว่างกระบวนการประกอบโซ่เปปไทด์ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) ซึ่งช่วยให้มั่นใจในขั้นตอนการกำจัดป้องกันและการจับคู่แบบเลือกเพศ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการเตรียมเปปไทด์ที่ซับซ้อนและเปปไทด์เลียนแบบ ซึ่งจำเป็นสำหรับการค้นพบและพัฒนายา นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มีฤทธิ์ชีวภาพและกรดอะมิโนที่ดัดแปลง เพื่อสนับสนุนการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมในงานวิจัยเภสัชกรรม