สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตายตัว (Solid-phase peptide synthesis: SPPS) สารนี้ทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยกลุ่ม fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) ป้องกันความเป็นกรดอะมิโนหลัก และกลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ป้องกันอะมีนทุติยภูมิ กลยุทธ์การป้องกันแบบคู่นี้ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันแบบเลือกเพศได้ในระหว่างการสร้างเปปไทด์แบบขั้นตอน ซึ่งช่วยให้ควบคุมลำดับได้อย่างแม่นยำและลดปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อนที่มีโครงสร้างเฉพาะ เช่น ที่ใช้ในงานวิจัยเภสัชกรรม การพัฒนายา และการศึกษาทางชีวเคมี ความเสถียรและความเข้ากันได้กับโปรโตคอล SPPS ทำให้เป็นสารเคมีสำคัญในการผลิตเปปไทด์สำหรับการบำบัด การวินิจฉัย และการวิจัย