Boc-D-Gln-OH เป็นสารเคมีที่ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งเป็น protecting group สำหรับกรดอะมิโน D-glutamine ในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นวิธีการหลักในการสร้างเปปไทด์ในห้องปฏิบัติการ สารนี้ทำหน้าที่ป้องกันกลุ่มฟังก์ชัน amine ของ D-glutamine ระหว่างการสังเคราะห์ ทำให้ป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์และควบคุมลำดับของเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ รูปแบบ D-enantiomer นี้ช่วยเพิ่มคุณสมบัติเฉพาะ เช่น ความต้านทานต่อการย่อยสลายจากเอนไซม์ในเปปไทด์รักษาโรค นอกจากนี้ Boc-D-Gln-OH ยังถูกนำไปใช้ในการศึกษาทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา เพื่อพัฒนายาใหม่ๆ และสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่มีโครงสร้างเปปไทด์เป็นพื้นฐาน