ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับสารตกค้าง cysteine เพื่อป้องกันปฏิกิริยา side ที่ไม่ต้องการระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์ กลุ่ม Boc ปกป้อง functional group ของ amine ในขณะที่กลุ่ม S-tert-butylmercapto ปกป้อง thiol group (-SH) ของ cysteine ทำให้เกิด reactivity ที่ selective โดยเฉพาะในกระบวนการป้องกันกลุ่มเมอร์แคปโต (-SH) ช่วยให้สามารถควบคุมการเกิดพันธะไดซัลไฟด์ได้อย่างแม่นยำ สารนี้มีค่ามากในการผลิตเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน ซึ่งต้องการการควบคุม protection และ deprotection ของ functional groups อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายา peptide-based และงานวิจัยทางชีวเคมีเพื่อศึกษากลไกของเอนไซม์ ปฏิกิริยาที่เกี่ยวข้องกับกลุ่มไทออล และรักษาความสมบูรณ์ของสารตกค้าง cysteine สำหรับการพับตัวและการทำงานที่เหมาะสม