Nepsilon-Boc-D-lysine t-butyl ester hydrochloride เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีน โดยเฉพาะในกระบวนการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันของกรดอะมิโน เช่น กลุ่มอะมิโนในสายข้างของไลซีน สารนี้ช่วยให้สามารถควบคุมและเลือกปฏิกิริยาเฉพาะที่ได้ดีขึ้นในขั้นตอนการสังเคราะห์ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยทางเภสัชวิทยาและเคมีอินทรีย์เพื่อพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพใหม่ ๆ เนื่องจากมีความเสถียรและง่ายต่อการกำจัดกลุ่มป้องกันในขั้นตอนสุดท้ายของการสังเคราะห์