Fmoc-3,3-diphenyl-L-alanine ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) ซึ่งทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างหลักสำหรับการนำหมู่ diphenylalanine เข้าสู่โซ่เปปไทด์ ช่วยเพิ่มความเสถียรและความสัมพันธ์ในการจับของเปปไทด์ สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายา 기반เปปไทด์และวัสดุชีวภาพ โดยการรวมกลุ่มอะโรมาติกขนาดใหญ่สามารถมีอิทธิพลต่อคุณสมบัติการกำหนดรูปแบบของเปปไทด์และปฏิกิริยากับเป้าหมายทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์ peptidomimetics และการวิจัยที่มุ่งศึกษาปฏิกิริยาระหว่างเปปไทด์-โปรตีน ทำให้เป็นเครื่องมือสำคัญในเคมียารักษาและชีวเคมี