Boc-(S)-alpha-(4-methylbenzyl)proline ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับกรดอะมิโนโปรลีน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการป้องกันกลุ่มอะมิโน (amino group) เพื่อให้เกิดปฏิกิริยาเลือกสรรในการสร้างพันธะเปปไทด์ สารนี้มีคุณค่ามากในการผลิตเปปไทด์ซับซ้อนและเภสัชภัณฑ์ ที่ต้องการการควบคุมปฏิกิริยาของกรดอะมิโนอย่างแม่นยำ กลุ่ม Boc สามารถถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เป็นเครื่องมือที่หลากหลายในเคมีอินทรีย์และเคมียา นอกจากนี้ยังช่วยในการสังเคราะห์สารประกอบชีวภาพและสารตั้งต้นยา สนับสนุนการพัฒนายารักษา