ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ช่วยในการสร้างโซ่เปปไทด์อย่างควบคุม โดยเฉพาะในงานวิจัยทางเภสัชกรรม กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ให้ความเสถียรระหว่างการสังเคราะห์ ในขณะที่กลุ่มเมทอกซี่สามารถมีอิทธิพลต่อกิจกรรมทางชีวภาพของเปปไทด์ ใช้กันทั่วไปในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท มะเร็ง และโรคเมแทบอลิซึม เนื่องจากความสามารถในการเลียนแบบกรดอะมิโนตามธรรมชาติและปรับเปลี่ยนปฏิสัมพันธ์ของเปปไทด์