สารนี้ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และโมเลกุลทางชีวภาพอื่น ๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ในการสร้างเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพ โดยกลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่อะมิโน ในขณะที่กลุ่ม Boc (tert-Butyloxycarbonyl) ปกป้องหมู่อะมิโนของไพเพอริดินิล ทำให้สามารถควบคุมการเกิดปฏิกิริยาได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในงานวิจัยที่เกี่ยวข้องกับเปปไทด์และโปรตีน