DL-Ser-Obzl.HCl ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของเซรีน กลุ่มเบนซิล (Bzl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับโซ่ข้าง hydroxyl ของเซรีน เพื่อป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ สารประกอบนี้มีประโยชน์โดยเฉพาะในสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) และสังเคราะห์แบบเฟสของเหลว ซึ่งการป้องกันและถอนการป้องกันแบบเลือกสรรของกลุ่มฟังก์ชันมีความสำคัญ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมเปปไทด์ที่มีเซรีนสำหรับการวิจัยในชีวเคมีและเภสัชวิทยา ช่วยในการศึกษาคุณสมบัติโครงสร้างและหน้าที่ของเปปไทด์ และทำหน้าที่เป็นสารกลางในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนมากขึ้น รวมถึงสารประกอบชีวภาพและผู้สมัครยา