FMOC-HOMOSER(TRT)-OH ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ในการสร้างสายเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพ สารเคมีนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยสร้าง (building block) ที่ช่วยในการเชื่อมต่อกรดอะมิโนเข้าด้วยกัน โดยกลุ่ม FMOC (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) ที่สามารถกำจัดออกได้ง่ายในขั้นตอนการสังเคราะห์ ส่วนกลุ่ม TRT (Trityl) ช่วยป้องกันกลุ่มข้างเคียงของกรดอะมิโนไม่ให้เกิดปฏิกิริยาในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ทำให้ได้เปปไทด์ที่มีความแม่นยำและประสิทธิภาพสูง นอกจากนี้ ยังมีการใช้ในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา เพื่อพัฒนาสารประกอบใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษาโรค