Fmoc-D-Lys(Dde)-OH เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) สารนี้ทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยกลุ่ม Fmoc ปกป้องส่วนปลายอะมิโน และกลุ่ม Dde ปกป้องสายข้างของไลซีน การป้องกันแบบคู่นี้ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันแบบเลือกเพศได้ ส่งผลให้สามารถสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อนที่มีลำดับเฉพาะเจาะจงได้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีคุณค่าต่อการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มีไลซีนหลายตำแหน่ง เนื่องจากให้กลยุทธ์การป้องกันแบบออร์โธกอนัล นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมยาที่มีฐานเป็นเปปไทด์ วัสดุชีวภาพ และเครื่องมือวิจัย ซึ่งต้องการการควบคุมโครงสร้างเปปไทด์อย่างแม่นยำ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การพัฒนาไลบรารีเปปไทด์สำหรับการค้นพบยาและการศึกษาทางชีวเคมี