Boc-Orn(Z)-OH เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในขั้นตอนการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันของกรดอะมิโนออร์นิทีน เพื่อให้การสร้างพันธะเปปไทด์เป็นไปอย่างมีประสิทธิภาพ และหลีกเลี่ยงปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการ กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ป้องกันกลุ่มอะมิโนอัลฟา ในขณะที่กลุ่ม Z (benzyloxycarbonyl) ป้องกันกลุ่มอะมิโนเดลตาในห่วงข้างของออร์นิทีน โดยปล่อยให้กลุ่มคาร์บอกซิลอิสระสำหรับการจับคู่ สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มีความซับซ้อน นอกจากนี้ยังมีการใช้ในงานวิจัยทางเคมีอินทรีย์และการพัฒนายา โดยเฉพาะยาเปปไทด์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง