Boc-Orn(Dnp)-OH เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะกลุ่มป้องกันสำหรับกรดอะมิโน กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ป้องกันความเป็นฟังก์ชันอะมีน ในขณะที่กลุ่ม Dnp (dinitrophenyl) ป้องกันสายข้างของออร์นิทีน การป้องกันแบบคู่สองนี้ช่วยให้สามารถถอดกลุ่มป้องกันแบบเลือกเพศได้ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อนได้อย่างแม่นยำสูง สารนี้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) ซึ่งขั้นตอนการถอดกลุ่มป้องกันที่ควบคุมได้มีความสำคัญสำหรับการสร้างโซ่เปปไทด์ตามลำดับ นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาคุณสมบัติโครงสร้างและการทำงานของเปปไทด์ รวมถึงการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ที่ใช้ฐานเปปไทด์