Boc-Asp-OtBu เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีน โดยเฉพาะในขั้นตอนการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันของกรดแอสปาร์ติก (Aspartic acid) ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) และกลุ่ม OtBu (tert-butyl ester) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันที่ช่วยป้องกันไม่ให้กรดแอสปาร์ติกทำปฏิกิริยาในขั้นตอนที่ไม่ต้องการ ซึ่งจะถูกเอาออกในภายหลังเมื่อสิ้นสุดกระบวนการสังเคราะห์ นอกจากนี้ Boc-Asp-OtBu ยังถูกใช้ในงานวิจัยทางเคมีชีวภาพและการพัฒนายา โดยเฉพาะในการสร้างเปปไทด์ที่มีบทบาทสำคัญทางชีวภาพ เช่น เปปไทด์ต้านเชื้อแบคทีเรียหรือเปปไทด์ที่ใช้ในการศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์ การใช้สารนี้ช่วยให้การสังเคราะห์เปปไทด์มีความแม่นยำและมีประสิทธิภาพมากขึ้น อีกทั้งยังลดปัญหาการเกิดปฏิกิริยาข้างเคียงที่ไม่ต้องการอีกด้วย