Boc-Cys(Acm)-OH เป็นสารที่ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในรูปแบบที่ป้องกันของซิสเตอีน กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ปกป้องกลุ่มอะมิโน ในขณะที่กลุ่ม Acm (acetamidomethyl) ปกป้องโซ่ข้างไธออลของซิสเตอีน การป้องกันแบบคู่ช่วยให้สามารถกำจัดปกป้องอย่างเลือกสรรได้ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ เพื่อรักษาความสมบูรณ์ของโซ่เปปไทด์ สารนี้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) ซึ่งต้องการการเพิ่มกรดอะมิโนแบบควบคุมและต่อเนื่อง สารนี้ยังใช้ในการเตรียมเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับการก่อตัวพันธะไดซัลไฟด์ ซึ่งสำคัญต่อความเสถียรของโครงสร้างและกิจกรรมทางชีวภาพของเปปไทด์จำนวนมาก การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการพัฒนายา รวมถึงยาที่มีฐานเปปไทด์และสารบำบัด