Nε-Carbobenzoxy-L-lysine ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะกลุ่มป้องกันสำหรับกลุ่ม ε-อะมิโนของไลซีน การป้องกันนี้มีความสำคัญอย่างยิ่งในกระบวนการสังเคราะห์เพื่อป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์และให้แน่ใจถึงลำดับที่ถูกต้องของกรดอะมิโนในโซ่เปปไทด์ เมื่อการสังเคราะห์เปปไทด์เสร็จสิ้น กลุ่ม Nε-Carbobenzoxy สามารถถูกกำจัดออกอย่างเลือกเฉพาะโดยไม่กระทบต่อกลุ่มฟังก์ชันอื่นๆ ในโมเลกุล สารเคมีนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน ซึ่งการควบคุมสภาวะปฏิกิริยาอย่างแม่นยำเป็นสิ่งจำเป็น นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการพัฒนายา รวมถึงการสังเคราะห์ยาที่มีฐานเปปไทด์และสารประกอบชีวภาพที่มีฤทธิ์ บทบาทของมันในการอำนวยความสะดวกในการประกอบเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพและแม่นยำทำให้เป็นสารเคมีสำคัญในทั้งการวิจัยและการตั้งค่าทางอุตสาหกรรม