Boc-Lys(Ipr)-OH ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ช่วยในการเพิ่มไลซีนเรซิดิวเข้าสู่โซ่เปปไทด์อย่างควบคุมได้ กลุ่ม Boc ให้การป้องกันชั่วคราวแก่กลุ่มอะมิโน ขณะที่กลุ่ม Ipr ปกป้องสายข้างของไลซีน ทำให้เกิดปฏิกิริยาเลือกสรรได้ในระหว่างการสังเคราะห์ สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตเปปไทด์ซับซ้อนสำหรับการวิจัยเภสัชภัณฑ์และการพัฒนายา ซึ่งการประกอบลำดับที่แม่นยำเป็นสิ่งสำคัญ นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษากโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีน โดยช่วยในการสร้างเปปไทด์ที่ดัดแปลงสำหรับการตรวจสอบทางชีวเคมี