ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะหน่วยสร้างหลัก ซึ่งช่วยให้สามารถป้องกันกลุ่มอะมิโนได้อย่างเลือกสรร โดยกลุ่ม Fmoc ช่วยปกป้องสายข้างของไลซีน ในขณะที่กลุ่ม Alloc ปกป้องกลุ่ม α-อะมิโน ทำให้สามารถใช้กลยุทธ์การถอดป้องกันแบบออร์โธกอนัลได้ นี่เป็นประโยชน์อย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (solid-phase peptide synthesis) ซึ่งต้องการการประกอบเปปไทด์แบบลำดับและควบคุม โดยทั่วไปแล้วจะใช้ในการผลิตเปปไทด์ที่ซับซ้อนสำหรับการวิจัยทางเภสัชกรรม การพัฒนายา และการศึกษา biochemical การป้องกันแบบคู่ช่วยให้มีความจำเพาะสูงและมีประสิทธิภาพในการสร้างโซ่เปปไทด์ที่มีลำดับที่แม่นยำ