สารนี้ใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในเคมีเปปไทด์ ทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยกลุ่มเทอร์ต-บิวทอกซีคาร์บอนิล (Boc) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับส่วนเอมีโน ซึ่งช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกสรรที่ตำแหน่งอื่นของโมเลกุลโดยไม่กระทบต่อกลุ่มเอมีโน สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ซับซ้อนและเภสัชภัณฑ์ เพื่อการสร้างโซ่เปปไทด์แบบขั้นตอน นอกจากนี้ หมู่ pent-4-enoic acid ยังให้ความยืดหยุ่นสำหรับการปรับแต่งเพิ่มเติม ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาสารชีวภาพและสารกลางยา