สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะกลุ่มป้องกันสำหรับกรดอะมิโน การนำไปใช้ช่วยให้การป้องกันแบบเลือกสรรของกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะเจาะจงในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่พึงประสงค์ รูปแบบเกลือ dicyclohexylammonium ช่วยเพิ่มความละลายในตัวทำละลายอินทรีย์ สนับสนุนการใช้ในปฏิกิริยาอินทรีย์ต่างๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน ช่วยในการศึกษากโครงสร้างและหน้าที่ ความคงตัวภายใต้สภาวะกรดทำให้เหมาะสำหรับใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอนแข็ง ซึ่งการถอดป้องกันที่ควบคุมได้มีความสำคัญต่อผลลัพธ์ที่สำเร็จ