N-(tert-Butoxycarbonyl)-L-cysteine methyl ester เป็นอนุพันธ์ที่ได้รับการป้องกันของ L-cysteine ซึ่งใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ กลุ่ม Boc ปกป้องหมู่แอมิโน α ในขณะที่เอสเตอร์เมทิลปกป้องกรดคาร์บอกซิลิก ทำให้สามารถถอนการป้องกันและคัปปลิงแบบเลือกเฉพาะในการประกอบเปปไทด์ หมู่ thiol ด้านข้างที่เป็นอิสระยังคงไม่ได้รับผลกระทบ อนุญาตให้เข้าร่วมในการก่อตัวพันธะไดซัลไฟด์หรือปฏิกิริยาอื่นๆ ตามต้องการ สารนี้มีความสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง (SPPS) สำหรับการสร้างลำดับเปปไทด์ที่มี cysteine อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยทางชีเคมีเพื่อศึกษาการพับตัวของโปรตีนและการเชื่อมโยงไดซัลไฟด์ ความคงทนของมันภายใต้สภาวะต่างๆ ทำให้เป็นสารสำคัญในเคมีอินทรีย์และเคมียาในการสร้างเปปไทด์และโปรตีนที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ