N-(Triphenylmethyl)-DL-serine Methyl Ester ถูกนำมาใช้ในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในขั้นตอนการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันของกรดอะมิโน เพื่อให้สามารถทำปฏิกิริยาเคมีเฉพาะที่ตำแหน่งอื่นๆ ของโมเลกุลได้โดยไม่เกิดผลข้างเคียง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์และชีวเคมี เพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกการทำงานของสารต่างๆ ในระบบชีวภาพ รวมถึงการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่มีความจำเพาะสูง