สารประกอบนี้ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) มันทำหน้าที่เป็นรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของซิสเตอีน โดยที่กลุ่ม Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ปกป้องกลุ่มอะมิโน และกลุ่ม STBU (tert-butylsulfanyl) ปกป้องโซ่ข้างไทออลของซิสเตอีน การป้องกันนี้มีความสำคัญเพื่อป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ระหว่างกระบวนการประกอบเปปไทด์ สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ประกอบด้วยสารประกอบซิสเตอีน ซึ่งเสี่ยงต่อการเกิดออกซิเดชันและการก่อตัวพันธะไดซัลไฟด์ การประยุกต์ใช้ของมันมีความสำคัญในการผลิตเปปไทด์สำหรับการวิจัย ยา และเทคโนโลยีชีวภาพ ซึ่งต้องการการควบคุมที่แม่นยำในการรวมซิสเตอีน นอกจากนี้ ยังช่วยให้สามารถสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อนที่มีรูปแบบพันธะไดซัลไฟด์เฉพาะ ซึ่งมักจะสำคัญสำหรับกิจกรรมทางชีวภาพ