Fmoc-D-His(Fmoc)-OH ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) สารนี้ทำหน้าที่เป็นรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของ histidine (ไอโซเมอร์ D) โดยที่กลุ่ม Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ปกป้องส่วน amino และ imidazole ระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ การป้องกันนี้ช่วยให้เกิดการ deprotection และ coupling ที่เลือกเฉพาะ ซึ่งเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อนด้วยความแม่นยำสูง สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มี histidine residues ซึ่งมักมีส่วนเกี่ยวข้องกับการจับกับโลหะ การเร่งปฏิกิริยาเอนไซม์ และการโต้ตอบระหว่างโปรตีน การประยุกต์ใช้นี้จำเป็นสำหรับการผลิตเปปไทด์เพื่อการวิจัย ยา และเทคโนโลยีชีวภาพ ซึ่งการประกอบลำดับที่ถูกต้องต้องแม่นยำ