สารเคมีนี้ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยกลุ่ม fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับหมู่เอมีน ซึ่งช่วยให้สามารถคัดลอกการกำจัดป้องกันและการจับคู่อะมิโนกรดได้อย่างเลือกสรรในระหว่างการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) ส่วนของ phenylpentanoic acid ช่วยเพิ่มความหลากหลายทางโครงสร้างให้กับเปปไทด์ ทำให้สามารถสร้างลำดับเปปไทด์ที่ซับซ้อนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง การประยุกต์ใช้ของมันมีความสำคัญในการพัฒนาเปปไทด์บำบัด peptidomimetics และเครื่องมือวิจัยทางชีวเคมี