Fmoc-D-Bip(4,4’)-OH ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) เนื่องจากกลุ่ม Fmoc (9-fluorenylmethoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันที่สามารถกำจัดออกได้ง่ายด้วยเบส เช่น ไพเปอรีดีน ในขณะที่กลุ่ม -OH ช่วยในการเชื่อมต่อกับกรดอะมิโนอื่นๆ เพื่อสร้างสายเปปไทด์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีน รวมถึงการพัฒนายาเปปไทด์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง