สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในวิธีการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตาย (SPPS) โดยทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยกลุ่ม fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับหมู่ฟังก์ชันอะมิโน ซึ่งช่วยให้สามารถเพิ่มกรดอะมิโนตามลำดับเพื่อสร้างเปปไทด์ด้วยความแม่นยำและประสิทธิภาพสูง ส่วนของ indole ในโครงสร้างทำให้มีประโยชน์โดยเฉพาะสำหรับการรวมอนุโลมทริปโตเฟนเข้าไปในโซ่เปปไทด์ ซึ่งมีคุณค่าในการศึกษาคุณภาพโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีน นอกจากนี้ ลักษณะแบบ chiral ของมันยังช่วยให้การสังเคราะห์เปปไทด์ที่มี stereochemistry เฉพาะ ซึ่งสำคัญสำหรับกิจกรรมทางชีวภาพและการวิจัยในการพัฒนายา